Das Bundesverdienstkreuz wurde ihm bereits 2013 verliehen. Der „Focus“ und der „Stern“ listen ihn regelmäßig als einen der besten Medizinier Deutschlands in seinem Fachbereich. Universitäten und Hochschulen schätzen sich stolz, wenn sie ihn als Dozenten gewinnen können. Jetzt hat die bayerische Gesundheitsministerin Judith Gerlach Professor Johannes Kraft die Staatsmedaille für seine Verdienste auf dem Gebiet der Gesundheit, Pflege und Prävention verliehen. Zusammen mit 15 weiteren Persönlichkeiten aus Bayern nahm der angesehene Altersmediziner aus Coburg die höchste Auszeichnung, die das Gesundheitsministeriums zu vergeben hat, am Donnerstag in München entgegen.